Si tu as planté tes tomates quand elles avaient des vraies feuilles (celles qui apparaissent au-dessus des feuilles simples un peu grasses que tu appelles sans doute cotylédons) ça n'a plus aucune importance : les vraies feuilles doivent avoir pris le relais pour la fonction chlorophyllienne et les racines pour les fonctions de nutrition.